A Cities: Skylines továbbra is rendkívül népszerű városépítős epizód, aminek az állandó frissességét többek között a modok is garantálják. A modtámogatás a Steamen keresztül a Workshop rendszeren keresztül működik, de más platformokon a játékosoknak kell begyűjtenie ezeknek.
Úgy tűnik, hogy a Chaos és Holy Water néven futó modder több, mint 35 000 játékos gépére telepített kártékony kódot. A módszer az volt, hogy egy moddal hamis hibaüzenetet dobált a játékosok elé, majd a játékosokat arra ösztönözte, hogy az ő modkliensét töltsék le, ami viszont már olyan kártékony kódokat tartalmazott, ami tönkretették a többi módot, a játék teljesítményét és kémkedett más modderek után.
A Steam törölte a modokat a Workshopból, de a Github és egyéb helyeken fellelhető változatokkal nem lehet mit tenni, így különös óvatosságra intenek mindenkit a moddolások során.
